岐阜の女子高生ハルカは、満開の桜並木から異世界へと迷い込んだ。そこは桜の恩恵で栄える「桜の世界」だったが、今、魔物の脅威に瀕していた。 伝説の「桜のプリンセス」として覚醒したハルカは、寡黙な騎士アヤト、好奇心旺盛な薬師の娘リンと共に、この世界を救う旅に出る。道中、桜の力で人々を癒し、仲間との絆を深めていくハルカ。しかし、その先に立ちはだかるのは、かつてこの世界を守ろうとして絶望に囚われた元研究者、ゼノスだった。 故郷を思い出すたけのこご飯の味、共に戦う桜鳥や松針獣、そして心に響く「魂の木霊」――。多くの出会いと経験が、ハルカの桜の力を開花させていく。 果たしてハルカは、ゼノスがもたらした悲劇を乗り越え、この世界に再び希望の桜を咲かせることができるのか？ これは、生命の力を「育種」し、愛と絆で世界を救う、プリンセスと仲間たちの物語。