21世紀生まれの人間は、全員魔法が使えるというパラレルワールド。 そのおかげで、現代は魔法による文化や技術が発展していった。 そんな中、錬金術師の兄・ジン・ミカガミに憧れる見習い錬金術師の女子高生・レンは、卒業研究の一環で、ホムンクルスを練成しようとする。 見事、錬成に成功したが、そのホムンクルスは自称：最強の冒険者・アレックス・ホーク（通称：アレク）の魂が憑依していた。 異世界から転生したアレクは、どうやら魔王との戦いで、落命した模様。 アレクは元の身体に戻るまでの間、ミカガミ兄妹が暮らす万屋・水鏡屋で暮らすことになる。