かつて、世界地図の上から小さなひとつの国家が姿を消した。便宜上の消した、ではなく、実際に消えてしまったのだ。 人知を超えた驚異的な災いが、国そのものを滅ばしたのである。 その驚異とは、絶対的破壊を齎す魔神と呼ばれる存在であった。 全人類に対するこの壊滅的窮地を脱するべく、世界各地からエージェント達が呼び集められる。そして選ばれた幼児の肉体を依代にして、見事魔神の封印に成功するのだ。 この時を境に、日本各地で異能力を持つ子供達が多数確認され始める。 やがてそのような特殊な能力を備えた子供達のことを、政府の一部機関では神童と呼び身柄の確保に動き始めるのだった。 政府は彼らを保護するという名目でとある施設に収監すると、極秘裏に様々な人体実験を行うこととなる。 そしてその研究の成果によって、とある計画が発案されるのだ。 その名は、『神童計画』 それは能力者達を、国土防衛の要とする計画であった。 時は流れ現代。魔神を体内に封印した幼児も今や高校生となっていた。その青年の名は、宇童(うどう)ヒロト。 神奈川県下最大規模を誇る暴走族集団、関東狂走連合會との死闘を皮切りに、徐々にヒロトの肉体は変化を現し始める。 そして国内最大規模の嵐に見舞われた神奈川県内において、彼の通う学園を舞台に激動の一日が幕を開けるのであった。 関東狂走連合會のメンバーとの対決。更に、外国人武装集団の襲撃、そして、ヒロトの身柄確保に動きだした自衛隊神童育成機関所属の面々。 学園内で繰り広げられる数々の闘いが、この運命のたった一日に全てを賭けるのである。 それは、人類最悪の魔神復活が約束された日であり、それを阻止出来るか否かはヒロトに託されることとなるのだった。 闘いを終えた後、ヒロトは今までの自分からまったく別の存在へと生まれ変わるのだが、これはその重要な一日を記録した物語であり、その後の神童達が繰り広げる激しい闘いの序章となる物語である。