主人公は、魔法学校の落ちこぼれ生徒であるアメリが偶然作り出してしまった傑作ホムンクルス・ロベルトとして転生してしまう。 それをきっかけとして、アメリは退学を回避し、もう一度やり直すチャンスを得る。しかし、ロベルトがホムンクルスとして革新的な存在であるが故に、様々な事件へと巻き込まれて行くことになり…