2087年、第二次冷戦下の中立都市ハーメルン・ノヴァは、神経インプラントを汚染する悪性AI「ラット」に襲われる。謎の技術者パイパーが現れ、神経共鳴器でラットを一掃するが、都市は約束した報酬を拒否。パイパーの正体は、かつて同じように裏切られた科学者の娘セレナだった。彼女は神経共鳴器で若者たちを導き、新都市を建設。信頼を失った旧都市は衰退するが、一年後、過ちを認めて謝罪することで和解が成立。二つの都市は姉妹都市となり、「約束を守ることは未来を守ること」という教訓を胸に、新たな中立の形を模索し始める。