永遠の夜に包まれる災害空間「マイナス」。一般的に、人間は立ち入っただけで「アンバー」と呼ばれる異形へと姿を変えてしまう。 世界の90%がマイナス空間に侵食された今、生き残った人類はマイナスに怯えながらも営みを続けていた。 そんなマイナス空間に生身で立ち入ることが出来る唯一の人間、ヨナは、防衛軍が極秘で組織している特務武装部隊に雇われ、アンバーの掃討で生計を立てていた。 口調が荒く、喧嘩っ早いヨナだが、あらゆる体勢から精密な射撃を可能にする他、肉弾戦も熟知する戦闘のエキスパートでもある。しかし、ヨナは素性が知られるのを嫌い、防衛軍への正式な入隊を拒んでいた。 ある日ヨナと相棒(？)のアキは、防衛軍、そして政府の根幹を揺るがす大事件に遭遇する。その調査に同行したヨナは、巨大な陰謀に巻き込まれていくも、かつてヨナの全てを失わせた真実を知るために正式に防衛軍への入隊を決意するが…。