頻発する大災害により、陸地の大部分が水没した世界。 かつて水の都と呼ばれた大阪は、今や空に浮かぶ安全な要塞都市「スカイタウン」となり、人々は便利で豊かな生活を送っていた。 一方、僕――ユータが暮らすのは、水没した奈良の山間に残された小さな集落。 不便でも、自然と共に生きる昔ながらの暮らしを、愛する祖父と送っていた。 両親はスカイタウンの永住権を得るため「義務役」に就き、僕も月に一度、船でスカイタウンの学校へ通う。 「安全」と「不便」の二つの世界を行き来する日々。 どちらの生活も嫌いじゃない。 けれど、心の底では「このまま、この場所で、祖父と生きていきたい」と願っていた。 そんなある日、若草山を襲った未曾有の大地滑り。 たった一つの故郷は泥の海に沈み、最愛の祖父の安否もわからなくなってしまった。