巨大生物セルファの出現から15年。主人公夏宮双樹は、母と小さな弟と共に平凡な日常を送っていた。だが31体目のセルファ襲来をきっかけに、戦いの最前線へと巻き込まれていく。 花柩と呼ばれる対セルファ大型兵器と、キドの宿命を背負った一人の少年の物語。