人類を脅かす異形の存在「虚影（カゲ）」が都市を覆う世界。 女子高生の少女・蒼井セレスティアは、ごく普通の学園生活を送るはずだった。しかし、ある日、街で起こった不可解な連続事件を目撃したことから、彼女の運命は一変する。 彼女は選ばれた者だけが扱える「影装（シャドウギア）」を手にし、特殊部隊「夜影隊」の一員として、虚影と謎に満ちた事件に立ち向かうことになる。 仲間との絆、裏切りの疑念、そして自身の心の揺らぎ――少女は戦いの中で、人としての脆さと強さを知る。