百年もの間、人族と魔族は互いに不干渉だった。しかし、突如として二つの種族が交わる学校が設立された。 長いこと引きこもり生活を送っていた少年ルートは不運にもこの学校に通わなくてはならなくなった。 学校初日。人族は魔族に圧倒的な力の差を見せつけられ学校生活に絶望を感じていた。 学校という世界の縮図で今始まるルート少年の孤軍奮闘。