魔法が存在する未来。一握りの人が持つ才能を切っ掛けに世界は変わった。 2973年に始まった第七次世界大戦。別名"第二次魔導大戦"。1年続いたこの戦争に突如現れた七人の英雄の手により終結し、世界は再び平和と共存へと進んでいった。 大戦終結から10年。世界は再び和平と協和を象徴する為に技術を結集し、日本近海の太平洋沖に巨大な洋上メガフロート"六芒"を建造した。 その一角、学区に創立された各校のエリート達が集う進学校"第十三魔導武装学院"に学院長の好意で劣等生である刹那も義妹と共に入学する事となった。 これは、動乱に呑まれる若き魔法騎士達が新たな英雄となる物語。