実習中に兵助が深手を負い自分を置いて逃げろと勘右衛門に告げ、足止めをした時だった敵を倒した時、深い穴に落ちたのだ。そんな行方不明の兵助を探すべく忍術学園上級生達が動く。一方兵助はなんと違う世界に飛ばされていたのだ…そんな中で違う世界では色々探すために巻き込まれた者達がいた。