魔導神政国家《レイグラント》では、教会と貴族が癒着し、無実の少女を「魔女」として裁く制度がまかり通っていた。 かつて魔女とみなされ幼馴染のエレナを殺された異端審問官ゼスト・ダンヴェールは、最前線に立つ異端審問官。だが彼の真の目的は、制度の内部から既得権益を崩すことだった。 そして実は、ゼストは古代先進文明が残した軍事観測衛星《アステリオン》のアクセス権を密かに握っていた。 ある日ゼストは、魔女の疑いをかけられた少女フェリシアを救い、自らが率いる地下組織へ迎え入れる。そこには王位継承権なき姫騎士セレスティアをはじめ、異世界の商人トキヤや異端者たちが集っていた。 彼らの標的は、数百年にわたり無垢な少女の身体を依り代として転生し続ける不死の支配者、大聖女レグニア。 教会の走狗を演じながら、ゼストは聖女を裁くことはできるのか？