帝都で功績を立てた探偵『ビー』は、皇帝の依頼で技術の街「ノーネルン」へと向かうため列車へと乗り込んだ。そこで出逢ったのは不思議な白い少女。彼女と共に出発した列車で彼は不思議な怪事件に巻き込まれることになる。 一方、探偵の仕事が浮気調査と変わった現代日本。 神琶露團と鮫島恋は夏期休暇を利用してサークルのOBである明智斗真の元でアルバイトをしていた。そこで受けた浮気調査を調べることになった二人は『再生の樹』という宗教団体の施設へと足を踏み入れる。そこで彼らは世界の『バグ』を見つけてしまう。 異なる世に存ずる『ソレ』は二つの世界を一つにする。