西暦2310年、地球よりはるかに優れた軍事力をもつ異星人「エスケータ」の侵略により、地球は陥落、防衛艦隊は宇宙の各地に放り出された。 宇宙戦艦『保食』も満身創痍の状態で、地球から10年の位置に放り出されてしまう。 地球の全面降伏まであと半年。『保食』の艦長である大森淳吾は、仲間の艦艇と合流しながら、地球を取り戻すための旅を始める。