ある日、少年・レインは山奥の廃墟で、一冊の黒い書を見つける。 それはかつて世界を滅ぼしかけた「深淵の鍵」を封じるために作られた記録書だった。 しかし封印はゆっくりと解け始め、現世の時間とは異なる「階層世界」が動き出す。 そこには、神話にも記されない上位存在――星々を創造し、物語すら書き換える者たちが蠢いていた。 レインは仲間たちと共に旅に出るが、やがて彼は知る。 「旅の終わりに待つのは、ひとりの男――遥斗。 あらゆる階層を超え、神すら殺す存在。」 人間であるはずの彼は、なぜその力を持つのか。 そして、黎明の向こうで待つものは破滅か、救済か――。