高校3年生の八百蓮司は、平均的で平凡な日々を送っていた。しかし卒業式の日、突如として世界中のアンドロイドが暴走し、人類が殲滅されるという悪夢のような出来事に直面する。しかし、彼は持っていた「あるモノ」の効力によって2年生の夏にタイムリープしてしまう。 突然の出来事に混乱する蓮司だが、未来の悲劇を防ぐことを決意し奔走する。彼は、同学年で学園のアイドル的存在の不破玲奈に秘密があることを知り、接近を試みると同時に、自身のタイムリープ能力の謎を解明しようと、高校1年の夏に出会った謎の人物「イサミ」の存在を追う。 果たして蓮司は、迫り来る人類滅亡の危機を回避できるのか。そして、玲奈との関係はどうなるのか。様々な想いが交錯し、AIと人類の未来を左右する、壮大なSFファンタジーが幕を開ける。