『魑魅魍魎』が跋扈するあらゆる可能性を内包した世界が増えたことで、いくつもの世界に名前が付けられた。 そんな世界の中でも最弱の『イザナギ』に向かうことになった少女シュクは、『パートナー』を探すように課題を出される。 一方、同じように『イザナギ』で『伴侶』を探せと命じられている少年クラウは、ある事件をきっかけにシュクと出会うのだった。