2045年。犯罪率の著しい増加に伴い、政府は優れた知能と推理力を持つ選ばれし少年少女達に捜査・逮捕権の行使を付与する法案を可決した。 そんな中、全国有数の事件解決数を誇る麗明学園”探偵部”に属する少女、蓮原うてなは、助手である百塚千里に日常生活に支障を来すレベルでガチ恋していた。 彼の一挙手一投足に目を奪われ軽犯罪の推理すらもまともに行えず、部内でも日に日に肩身が狭くなっていく蓮原。そんな彼女を見かねた百塚は、或る事件からのトラウマ故に秘めていた屈指の推理力を働かせて蓮原を操り、影から事件を解決に導いていくのだった。