染井吉野が絶滅した近未来。枯死した原因には諸説あったがどれも決め手がなかった。それでも世間の求めに応じ何度となく再生プロジェクトが立ち上がったが、失敗に終わった。 　それから百年近くが過ぎた。ゴドウィン教授が開発したクリーチャーメーカー（生物製造アプリ）を使い遺伝子情報に逆アセンブルを行い読み解く事が出来るようになった。穂村は奇跡的に発見された染井吉野のサンプルを使い再生を試みる事になった。