時は西暦三千年代。様々な自然災害を経て日本国土の半分以上が海に沈んでいた。 世界は一つの集合体という認識が強くなり、日本という国はなくなり、アジア地域極東地区と呼ばれていた。 その頃人類は核廃棄物に影響を受け急激に進化した虫――GB（GIANT　BUG）に加え新たに研究室から逃げ出したドラキュ蚊の襲撃に恐れをなしていた。 それに対峙すべく構成された防衛・厚生省。司令部のマスターである後垣　彗（あとがき　すい）はプレマスターの神田　北辰(かんだ　きたとき)を信頼し、昇進を期待していた。 しかし新しく移動してきたソルジャーとの折り合いが悪く、神田は独りで責任を抱え込んでいく。 思い悩んだ末の神田の決断は?彗のとった策略とは?