佐藤修平は、普通の高校生として平凡な日々を送っていた。友人との何気ない会話や、日常の中で過ごす時間が彼の幸せであった。しかし、ある日突然、目の前に現れた少女・リリィとの出会いが、彼の人生を大きく変えることになる。リリィは、修平に対して「あなたはこの世界に存在してはいけない」と告げる。最初はその言葉に驚き、理解できなかった修平だが、彼の存在がこの世界にとって危険であることが次第に明らかになっていく。 リリィによれば、修平は別の世界から転生してきた存在であり、その転生が不完全であったため、修平は『ニセモノ』としてこの世界に存在しているという。修平はその言葉を信じたくなかったが、彼の存在がこの世界のバランスを崩し、最終的には世界を危機に陥れる可能性があると警告される。修平は自分が普通の高校生であることが、まさか世界にとって重大な影響を及ぼすとは思いもよらなかった。 リリィは修平に、『本物』の自分を取り戻すように促す。そうすることで、修平は『ニセモノ』ではなく、この世界に正当な存在として生きることができるという。さらに、修平の前には不穏な人物からのメッセージが届く。「お前の存在は許されない」と告げるその言葉に、修平は強い危機感を抱く。 修平はリリィと共に、『本物』を取り戻す手がかりを求めて動き出す。二人は次々と立ちはだかる試練に立ち向かいながら、修平は次第に自分の力を覚醒させていく。『本物』を取り戻すことで、修平は自分を知り、平穏な日常を手に入れるのか、それとも…？修平の運命がどうなるのか、まだ誰にもわからない。