科学が終わり、魔術が世の根幹をなす時代。日本魔術学院の院長であり、「現代最高の魔術師」と謳われる「綾瀬川叶」は、一人の人物に講師を依頼する。その人物とは、2年の間に200人以上の人間を殺害したとされる、魔術史上最恐最悪の「狂気の魔術師（マッド・マジシャン）」である「水瀬優次郎」。多くの教師や生徒が反発する中、優次郎は叶の下で講師としての人生を始める。そして彼の講義や行動は、ゆっくりと、されど確実に学院を変えていく事となる。