メリーアンが不思議な博物館で働き始めてひと月が経ち、 夜間警備員の試用期間も終わろうとしていた。 「私、これからもここで働きたい！」 決意を固める中、展示室から妖精が盗み出されてしまいーー!? 「最後までこの博物館を守るって、決めたから」 国家転覆の危機に立ち向かったのは、博物館の少女だった。 今宵も、奇妙な博物館での仕事が幕を開けるーー！