地上が汚染された未来、人々は中空に国家を設立し暮らしていた。中空での暮らしには馴染んだが、人々の間では遺伝性の病が蔓延り、子供の数が減りつつある。それを抑制するために遺伝子の相性が良い者同士を見合わせる「ジーンプロジェクト」が発足した。 しかし、須藤シンラのプロジェクトの相手は女性ではなく子宮を有した男性体のアシュカーク（両性具有）、ザカリだった。