古代神話と未来的技術が衝突する世界において、 「ペタル」と呼ばれる極秘プロジェクトから生まれた三人の少女――ルーツ、ブルーム、ソーンズ。 それぞれが自然の異なる側面（根、花、棘）を体現する彼女たちは、 忘れ去られた戦争のための生体兵器として設計されながらも、 創造主はとっくに消え去り、目的を失い途方に暮れていた。 対立と謎に満ちた世界を生き抜きながら、 彼女たちは自らを定義する力と向き合い、 自らのアイデンティティを探求し、 与えられた役割を受け入れるか拒絶するかの決断を迫られる。