都内の大学に通う大学生、笹原はある時不思議な地震に襲われる。地震がおさまると、そこは宝暦年間の江戸だった。笹原は、共に巻き込まれた友人の夜叉ヶ峰、堺と江戸でどうにか生計を立てながら、奇才・平賀源内や、夜叉ヶ峰の先祖・宗右衛門、さらには後から迷い込んできた自分より若い年齢の祖母・トキとの出会いを経て、自分が何故こんなところに巻き込まれたのかに迫ろうとする。一方、外国船の脅威にさらされた幕府の内部では、人知れず歴史の分岐点が生まれようとしていた……