宝石人形、それは髪や瞳、爪に宝石の煌めきを宿した美しい人形。そして、宝石人形は魔法のような不思議な力を持っている。宝石人形をより輝かせ、不思議な力を使えるように導き、支えるのが宝石人形師の役目である。 宝石人形師養成学校に入学した16歳の少年リド。学校に入学すると、パートナーとなる宝石人形を選ぶ。 リドが選んだのは、無色透明の輝きを持つ、アクロアイト(ホワイトトルマリン)の宝石人形。 トルマリンには存在しない色はないと言われるほど、色彩豊かな宝石だ。 宝石人形師見習いのリドとアクロアイトの宝石人形は、どんなことを学び、どんな色を見つけていくのか……？ 宝石×学園ファンタジー！