ミレニアムの頃の秋葉原。超能力に＂覚醒＂した腐女子を狩る謎の組織の存在が浮上、腐女子達は恐怖の日々を送っています。一方、気候変動が顕在化した秋葉原に熱波が到来、異常に百合が増える現象が多発します。謎の組織の先兵であるメイド協会の公式カウンセラーを葬った主人公達でしたが、今度は警察権力の魔の手が伸びます。主人公の元カノ達の協力で危機を脱し、元カノ達との絆をさらに深めるのでした。