桜が咲き誇る時期に産まれた九重咲耶。彼女の名前は桜の女神、木花咲耶姫にちなんでつけられた。だから、咲耶にとって桜は特別だった。いつだって神様である咲耶姫が見守ってくれている気がしたから。 ブラック企業で働く咲耶は限界が来ていた。終電に乗り遅れ、途方に暮れながら人がいないオフィス街を歩いていた咲耶の目の前に、どこからか桜の花びらが飛んできた。導かれるように歩いていると、突然目の前に桜の大木が現れる。そして木の上には、咲耶にとって懐かしく優しい神様、木花咲耶姫がいた。