そう遠くない未来の話。急激な海面上昇にともない、世界はわずかに残された陸地「フジヤマ連邦共和国」と、海中に住む人々「水中都市アビス・ノヴァ」とに分断されていた。 世界にはそのどちらにも属さない小さな島々が点在している。その中にあるひとつの小さな島に生きる少女ミラ。 狭い島が世界の全てだったミラが島の外に出たとき、世界を揺るがす大事件と世界の真実があきらかにされていく。 少女の成長と、世界の行く末の物語。