世界は今、「時間」が停止する奇病「時間停止症候群」に蝕まれていた。人々は緩やかに過去を忘れ、未来への希望を失っていく。そんな中、忘れ去られた辺境の地にある「砂時計の宮殿」で暮らす少女、カノンは、世界で唯一「時間」を自在に操れる「記憶の番人」だった。彼女の使命は、世界の中心に存在する「時の大図書館」へ辿り着き、失われた全ての時間を修復すること。しかし、その道中、彼女を阻むのは、時間を喰らい肥大化した異形の怪物「タイムイーター」と、時間の停止を望む謎の組織。カノンは、過去と未来を紡ぎ、世界を救うことができるのか？──これは、時を超え、希望を繋ぐ少女の物語。