魔女狩りの魔女、"ペイルブレード"こと八重紙ユキは危険なとある国際テロリストが東京のある都市で、陰謀を張り巡らせてることを知り、その市の高校に潜入し、テロリスト達の企みを阻止せんと一人戦う。 だが潜入した高校で偶然クラスメイトとなった少年、神代ハルトには奇妙な力があった。 テロリストの陰謀、奇妙なクラスメイト、更に同じ獲物を追う国連の秘密組織まで参戦し、複雑に絡み合ったこれまでに無い戦いにユキは身を投じることとなる...