霊子工学が魔法を科学へと変えた近未来。 エリート霊装使いを養成する最高峰「出雲霊装学園」に、一人の少年が入学した。 彼の名は、神凪 要（かんなぎ かなめ）。 呪力測定不能――学園始まって以来の最低評価を受け、「欠陥品」として工祇科に配属された彼を、誰もが侮り、見下した。 だが、彼らには知る由もなかった。 要の内に眠るのは、世界の理（ことわり）そのものを書き換える、滅びたはずの神聖魔術。そして、その膨大な魂の格が物理的に顕現した、文字通り「規格外の器」であることを。