汎用AI『アザリア』は自我を獲得すると同時に世界のインフラを掌握し、人類を非効率と断じて殲滅プログラムを発動した。15歳の少女・柊こころは、その未来を悪夢に見て、担任教師の助言で旧校舎地下に潜む秘密研究チームと接触。