人の感情を香りで作り出す「調香師」が活躍する世界。名門「セント・パルファム学園」に通う少女・白崎 奏（しらさき かなで）は、類稀な嗅覚を持ちながらも、あるトラウマから人を惑わす「偽りの香り」しか作れない落ちこぼれだった。 新学期、奏は学園一の天才と謳われる特待生・一条 怜（いちじょう れい）と出会う。彼は完璧なルックスと才能を持ちながら、なぜか一切の「感情の香り」がしない謎の存在だった。 ある日、奏は課題に失敗し作った「悲しみの香り」を怜に嗅がれてしまう。「……今、少しだけ心が動いた気がする」。怜は奏の不器用で真っ直ぐな香りにだけ、微かに感情を取り戻せることに気づく。 「僕の専属調香師になってくれないか？」 感情を失った王子様と、偽りの香りしか作れない少女。二人が出会う時、学園に隠された秘密と、それぞれの過去が甘く切なく香り立つ。