日本の地方都市にある「黒曜学園」。この高校は、戦前に建てられた古い校舎と、敷地内に佇む「旧校舎」と呼ばれる廃墟が特徴。旧校舎には、数十年前に起こった「七不思議事件」と呼ばれる不可解な出来事がまつわる伝説があり、生徒の失踪や怪奇現象が語り継がれている。現代の生徒たちは、旧校舎への立ち入り禁止を言い渡されているが、好奇心や噂に引き寄せられ、主人公たちがその謎に挑むことで物語が始まる。