東京の絶対防音室で、公安特殊技能部は人類滅亡の危機に直面していた。謎の組織ミレニアムが、アレクサンダー・ヴォルコフの指揮の下、NASAのシステムを掌握し、隕石を地球に衝突させようとしていたのだ。しかも、隕石にはワクチンが存在しない恐るべきレトロウィルスが搭載されているという。