全世界を熱狂させたVRMMORPG『ネクサス・クロニクル』。しかし、運命のアップデート後、１万人のプレイヤーはログアウト不能の悪夢に突き落とされる。「これは、ゲームであってゲームではない」――痛覚はリアルに、空腹が襲い、仮想通貨は現実の価値を持ち始めた。さらに、プログラムされたはずのNPCたちが、まるで人間のように「意思」を持ち始める。現実世界では社会不適合者だった元プログラマーの青年カイトは、この変貌した世界で仲間を守るため、そして世界の真実を掴むため、立ち上がる。謎の管理者「アーキテクト」とは何者なのか？ 現実への帰還を望む者、新たな世界の覇権を狙う者、そして覚醒したNPCたち。様々な思惑が交錯する過酷なサバイバルの中で、カイトは仮想と現実の狭間で、未来を切り拓くことができるのか？ 今、新たな世界の年代記（クロニクル）が始まる。