人類は第三次世界大戦を引き起こしてしまった。そして人類が絶滅しかねない兵器の応酬に耐えかねた神は禁断の介入を行う。神の怒りにより電気、その他の文明の利器を封じられたのだ。神話の世界へと変わってしまった世界で主人公である最上雅人は人類に新たに与えられた「意思の力」で荒廃していく世界を生き抜いていく。雅人の意志である「超える意志」は魔物やダンジョンといった試練を超えるためにその力を発揮し、いつしか神を超え世界をもとの姿に戻すことを目標としていくことになる。偶然世界が変わる瞬間に居合わせた遥香、体育会系な友人の海斗、元看護師の雫といった仲間たちを得て、人類の力を結集し、いつしか超常の存在たる神を討伐することを信じて、雅人の挑戦が今、始まるー