祖母の死をきっかけに、主人公は十年ぶりに祖母の家を訪れる。かつて「開けてはいけない」と言われていた古い箪笥を開くと、「レナへ」と書かれた小箱と銀のオルゴールを見つける。オルゴールを鳴らすと、不思議な旋律とともに時間が止まったような空間が広がり、現れたのは「アヤ」と名乗る少女。 彼女は祖母の幼なじみで、病弱だったため短い人生を終えた存在だった。祖母がアヤのために作った「月光のオルゴール」は、記憶と心をつなぎ、時を超えて再会を叶える力を持っていた。主人公はオルゴールを通して、祖母の隠された優しさと過去、そしてアヤの想いに触れる。 短い邂逅ののち、アヤは静かにこの世を去り、主人公は祖母の温かい心と、繋がれた記憶の意味を胸に刻むのだった。