目が覚めたら見知らぬ場所に居た少年、オサム。 泣いていても始まらないと謎の広大な空間の散策を開始する彼であったが、その先で出会ったのは眼を起点に発動する異能〈EYE（アイ）〉を行使する怪物〈GORGON（ゴルゴン）〉と、彼らに対抗できる武器〈EYE-GIS（アイギス）〉を手にしたクローンの少女達であった。 地球上における人類最後の楽園であるメガフロート〈アトランティス〉も、すでにゴルゴンの巣窟。 誰もが勝利を諦める中、ただの一般人でしかないオサムもまた手を打つ術はない……かに思われた。 だがしかし、彼の覚醒が人類の反撃の合図であることを知る者は誰も居なかった。