令和の時代となっても、三重の伊賀忍者と滋賀の甲賀忍者はそれぞれの誇りと信念をかけて、人知れず争い合っていた。 だが彼らの長きにわたる戦いの歴史の中には、誰も知らぬ『滋賀忍者』が存在し、双方のタカ派を止めるべく2大流派のハト派と『三賀同盟』を組んで奔走していたのだ。 慰安旅行のため滋賀を訪れていたアデリーンたちの前に、その三賀同盟に属する滋賀忍者のくノ一・桜庭結衣菜率いる使者が助けを求めに現れて――。 っていうか、ナンデ忍者！？ アイエエエエエエエエエエエ～～～～～ニンジャナンデ！？