同級生のパリピグループの罠にはまり、人間不信に陥って、名門大学に入学したにも関わらず引きこもりと化した、内向的な大学生・佐伯信也は、かつて自身が改造した戦国シミュレーションゲームのプレイ中に、「本能寺の変」イベントによって、自ら作り上げた最強の織田信長に非業の死を与えてしまう。ところがゲームキャラクターであるはずの信長は、なんと怨霊と成って信也の前に現われた。 その日から一つの身体を二つの魂で共有する奇妙な共同生活が始まり、信也は信長の力を借りて、知力や戦闘力、そして人としての器を大きく成長させるが、反面寿命が縮まるリスクを負う。 それでも引きこもりの原因を解決し、大学生活を楽しみ始めた信也は、信長によって半強制的に音楽イベント「夏フェス」にギタリストとして参加し、そこでセミプロバンド「シャークス」のメンバー、天才ボーカリストの亜美、マルチプレイヤーの彰など、様々な出会いを経験して、大きく成長する。 その過程で信也は、タイプの違う三人の女性とロマンスが芽生え、大いに悩むが、最終的に人生の目標に向かって同じ道を歩む斎藤梨都を、パートナーに選んだ。 夏フェスが終わって、同じ大学に通う女子大生が、内臓を抜き取られて殺害されるという事件が起きる。信也は事件の真相を調べるうちに、東京都知事選に立候補する冴嶋佳実の選挙陣営にボランティアとして参加することになる。 未来のために子供を育てる環境を目指す冴嶋の姿は、信也の心に深い共感を呼び、何としても彼女を当選させようと本気に成るが、その背後では「インフェルノ」と呼ばれるハングレ組織が暗躍し、対立候補・進藤宗高の陣営が不穏な動きを見せていた。 インフェルノのリーダーは謎の男・御堂、そして進藤は戦国の梟雄松永久秀の転生者として強大な力で、信也の前に立ちはだかる。信也は信長の力を借りて、選挙演説中の冴嶋を襲う刺客を三度に亘って撃退し、彼女を無事当選に導いた。