封鎖された街、陽ノ谷市。そこは、人類の集合無意識から生まれた死の化身、エフィルが跋扈する死都である。 世界最大の魔術結社H.E.R.M.E.S.は、人類から生まれ、人類を殺戮するエフィルを殺す者――死殺者を用いて対抗した。 新たに着任した死殺者、外村陵は、厄介な同僚とバディを組まされ、エフィルと戦うことになる。 陽ノ谷市に住む高校生、楡原冬司は、エフィルに殺され、自らもエフィルとして蘇り、人類の敵となる。