遠い未来、人類は進化と繁栄を追い求め、数々の惑星へと進出していた。しかし、その陰で多くの自然と平和が犠牲となっていた。主人公ミラクルは、自然と調和を守るために戦う強力な魔法少女として、その理想を信じて戦っている。 一方、かつての仲間であり信頼していた相手、マスターは人類の未来のため、さらなる犠牲も厭わない強い信念を持っている。ある出来事をきっかけに、二人の信念が激しく衝突し、互いに相容れぬ道を選ぶことに。 戦いの果てに彼らはそれぞれの信念に直面し、平和と未来のためにどんな犠牲が正しいのか、深い葛藤の中で選択を迫られる。果たして、その選択は新たな未来をもたらすのか、それとも破滅への道なのか── 壮絶な戦いと信念の物語が、運命を揺るがす結末へと突き進む。