世界中の大都市の上空に出現した巨大ワープゲートによって、人類は滅亡の危機に瀕していた。 異世界から次々に送りこまれてくる魔獣達。既存の兵器は一切通用せず、戦える力を持つのは戦闘魔法に目覚めた一部の人間だけだった。 その一人、女子高生の咲弥凛もまた、滅びに向かう東京で仲間達と必死の戦いを続けていた。 凛の魔法は他者の魔力を爆発的に高めるＳ級強化魔眼。相棒のＡ級雷使い、直川唯と共にわずかな希望に賭けて魔獣達への反撃に出る。 しかし、あと一息のところで最強の魔獣に遭遇。相討ちに近い形で凛と唯は倒れてしまった。 命が尽きかけたその時、二人の魂は突如現れた次元の割れ目に吸いこまれる。 異空間を漂った末に辿り着いたのは、以前の世界とよく似たパラレルワールドだった。ただし、時間はワープゲート出現の約二年前。 その世界の自分達の魂と融合を果たした凛と唯は、ゲートの出現を阻止するべく動き出す。 鍵はゲートより前に各地に現れていたダンジョンにあった。 魂の融合によって新たな力を得た凛と唯は仲間達と共にダンジョン攻略に挑んでいく。 これは、絶望の未来を変えるべく奮戦する少女達の終末やり直し物語。