未来、全ての国家と社会は「システム・レガシー」と呼ばれる超高度情報管理システムによって統制されていた。これは生身の人間に「オムニス・コード」と呼ばれるプログラムをインストールし、人間の脳に演算の補助をさせるというものだった。人間の脳を必要とする事からシステム・レガシーは100年に一度オムニス・コードを継承する人間を求める。無論100年間脳を演算の補助に使われるという性質上、コードの継承は実質的に死を意味するのだが──しかしこのコードの継承は最高の名誉とされていた。 ある日、主人公ノア・クラインは「All Seeing Eye International」という軍需企業からの依頼を受け、そこから国際的な陰謀に巻き込まれる事となる。 システム・レガシーに干渉しようとする勢力と、オムニス・コードを巡る継承者達の思惑が交錯する中、ノアは双方の争いにその身を投じる事となる──