『スペースウォーリャーズ2』がリリースされてから二年が経過し、『スペースウォーリャーズ2』は大きな戦火に包まれていた。 ことの発端は資源採掘地帯『マテリアル・ベルト』の局所で起きたほんの小さな小競り合いだった。 『ネオ・プライマル』と『ピースコンパス』による小競り合いは瞬く間に『マテリアル・ベルト』全域に広がる戦火となった。 冴えない動画投稿者の倉島凛菜は動画を伸ばす起死回生の一手として『スペースウォーリャーズ2』の世界に飛び込んでいく。 キャラメイクも終わり、リスポーンしたところは、戦争真っ只中の『マテリアル・ベルト』のターミナルだった。 何とかターミナルの外へ逃げ出した凛菜だったが、すぐに戦闘に巻き込まれてしまう。 そんな時、『ノーザン隊』の隊長ハルヒに救われて、凛菜は『ノーザン隊』と行動を共にし、ピースコンパスの旗艦である『ノアの箱舟』にむかう。 そして戦争に巻き込まれ、彼女もまた才能を開花させていく―――