巨大な怪獣が街を壊し、それに立ち向かう魔法少女の戦い──は遠い昔の話。怪獣は封印され、それに伴い魔法少女たちも姿を消し、平穏を取り戻したはずだった。しかし、ある日突如として巨大生物が街に現れた。逃げ惑う人々。迫り来る巨大生物に万事休すと思われた瞬間、一人の魔法少女が巨大生物を打ち倒す。人類の危機を救った魔法少女に喜ぶ人々だったが、その巨大生物を街に解き放ったのは、討伐した魔法少女本人だった。